Su pasión por la dirección de orquesta le llevó a estudiar en España con los maestros Miguel Romea y Andrés Salado y en la International Conducting Academy de la Universität der Künste de Berlín con Steven Sloane y Harry Curtis. Durante sus estudios Fernando demostró una constante y sólida evolución, graduándose con honores en su concierto final.

Desde 2011, Fernando Bustamante es director musical y artístico de la Orquesta Ciudad de la Mancha, con la que ha cosechado gran éxito de público y crítica en diferentes festivales nacionales e internacionales y con la que han creado el curso y el festival internacional Arte Entre Gigantes.

Fernando ha sido invitado a participar en prestigiosas masterclasses con Daniele Gatti y la Royal Concertgebouw Orchestra, Robin Ticciati y la Deutsches Symphonie-Orchester; así como con los Maestros John Carewe, Kimbo Ishii, Arthur Fagen, Leo Brouwer y Michail Jurowski.

Ha dirigido Brandenburgisches Staatorchester Frankfurt, Deutsches Sinfonie-Orchester Berlin, Neubrandenburger Philarmonie, Brandenburger Symphoniker, Staatstheater Cottbus Orchester, Preußischen Kammerorchester, Kammerakademie Potsdam, Magdeburgische Philharmonie, Orquesta Sinfónica de Extremadura, Orquesta Sinfónica Verum, OPGB de Porto, Orquesta Nacional de Ecuador o Joven Orquesta de Extremadura entre otras.

En el campo de la música contemporánea, ha colaborado en numerosas ocasiones con el Ensemble Ilynx (Berlín).

Como instrumentista, a actuado y realizado giras con diversos grupos de cámara y orquestas por toda España, así como en EE.UU., Francia, Alemania, Rusia, Grecia, Argentina, Portugal, Luxemburgo, Austria, Italia, Colombia o Ecuador. Colabora regularmente con la Orquesta Nacional de España, Orquesta Sinfónica de Madrid, Fundación Excelentia, Orquesta Sinfónica de RTVE, Orquesta de la Comunidad de Madrid, Orquesta Filarmonía, Orquesta Sinfónica de Castilla y León o el Ballet Nacional de España entre otros.